Во вселенной, где Механизированная империя подавляет свободу, человечество подняло восстание. На Земле война длится уже много лет, и силы повстанцев тают с каждым днём. Среди них — [character=7950]Тэцуро Хосино[/character], отчаянно сражающийся за будущее своей планеты. Когда надежда почти угасла, в небе появляется легендарный Галактический экспресс 999, символ свободы и перемен. Внезапно [character=7950]Тэцуро[/character] получает загадочное послание от [character=6321]Мэйтел[/character], призывающее его вернуться на борт поезда.

С трудом прорвавшись сквозь вражеские заслоны, [character=7950]Тэцуро[/character] оказывается на станции, где его ждёт 999-й. Поезд, некогда изменивший его жизнь, снова уносит его в путешествие сквозь звёзды. Но на этот раз его ждёт не просто странствие — а новая миссия, полная опасностей и неразгаданных тайн. Кто стоит за посланием [character=6321]Мэйтел[/character]? Какие секреты скрывает Галактический экспресс? И сможет ли [character=7950]Тэцуро[/character] изменить ход войны?

Путешествие [character=7950]Тэцуро[/character] превращается в гонку против времени, где ставка — судьба всей галактики. На каждой станции его ждут новые испытания, загадочные встречи и неожиданные союзники. Но чем дальше он продвигается, тем больше понимает: ответы, которые он ищет, могут перевернуть всё, во что он верил. Сможет ли он разгадать тайну Механизированной империи до того, как человечество окончательно падёт?