Четырнадцатилетняя Мадока Канамэ ведет самую обычную жизнь, ничем не отличающуюся от жизни других школьниц. Она ходит в школу, общается с друзьями и увлеченно занимается своими любимыми делами. Однако все меняется, когда ей начинает сниться странный, почти мистический сон. В нем она видит загадочную битву, где юная волшебница сражается с темными силами. Этот сон настолько реалистичен, что Мадока просыпается в холодном поту, не понимая, что это было — просто кошмар или нечто большее.

На следующий день в школе Мадока встречает ту самую девушку из своего сна — Хамуру Акэми. Новенькая ведет себя крайне странно: говорит загадочными фразами, предупреждает об опасностях и настойчиво пытается что-то объяснить. Мадока поначалу не воспринимает ее всерьез, но вскоре понимает, что Хамура знает куда больше, чем кажется. Однако осознание приходит слишком поздно — мир вокруг начинает меняться, и теперь Мадоке предстоит сделать выбор, который определит не только ее судьбу, но и судьбу всего, что ей дорого.

Столкнувшись с невероятными событиями, Мадока оказывается перед сложным решением. Она не хочет ввязываться в чужие конфликты, но судьба дает ей понять — нейтралитета не будет. Чем глубже она погружается в этот загадочный мир, тем яснее осознает, что ее мечты о спокойной жизни рушатся. Теперь ей предстоит не только разобраться в происходящем, но и решить, готова ли она пожертвовать всем ради того, во что верит. И самое страшное — времени на раздумья почти нет.