Феодальная Япония, где правят меч и тень. В этом мире, полном предательства и кровавых заговоров, бродит одинокий воин — Дзюбэй [牙神獣 兵衛]. Ниндзя-ронин, не признающий господина, он продаёт своё мастерство тем, кто готов заплатить золотом или предложить достойную цель. Его лезвие не знает пощады, а репутация устрашает даже самых отчаянных. Но когда в глухой деревне вспыхивает таинственная чума, а посланные туда ниндзя бесследно исчезают, Дзюбэю предстоит столкнуться с угрозой, способной перевернуть весь мир.

Единственная выжившая — Кагэро, девушка-убийца, чьё прикосновение несёт смерть. Спасённая Дзюбэем от участи хуже гибели, она становится ключом к разгадке зловещего заговора. За эпидемией скрывается нечто куда более страшное: эксперименты, превращающие людей в чудовищ, и тайная организация, жаждущая власти. Дзюбэй, всегда избегавший чужих войн, теперь вынужден вступить в схватку, где ставка — не только его жизнь, но и судьба всей страны. Его противник — существо, не знающее страха, боли и жалости, рождённое в глубинах запретных технологий.

Клинок против когтей, хитрость против ярости. В этом противостоянии Дзюбэю придётся использовать все свои навыки, чтобы победить. Но даже если он выживет, сможет ли ниндзя без хозяина снова стать тенью, или эта война навсегда изменит его? Финал битвы определит, устоит ли Япония перед тьмой или падёт, разорванная на части теми, кто играет с силами, неподвластными человеку.