Наруто, Шикамару и Сакура отправляются на, казалось бы, обычную миссию — найти пропавшего питомца и доставить его обратно в деревню. Однако всё идёт не по плану, когда на них внезапно нападает группа загадочных ниндзя во главе с таинственным лидером по имени Тэмуджин. В разгар сражения Наруто теряет связь с товарищами и остаётся один, вынужденный искать их в незнакомой местности. В ходе поисков он сталкивается с необъяснимыми явлениями и узнаёт о древней силе, не связанной с чакрой.

Пока Наруто пытается разгадать тайну этой силы, он натыкается на следы давно исчезнувшей цивилизации, обладавшей невероятными технологиями. Тем временем Шикамару и Сакура тоже сталкиваются с загадками, пытаясь понять, кто стоит за нападением и какие цели преследует Тэмуджин. Когда команда наконец воссоединяется, они осознают, что стали частью чего-то гораздо большего — им предстоит сразиться за судьбу всего мира, столкнувшись с силами, превосходящими их прежние представления о возможном.

Теперь троице предстоит не просто выполнить миссию, а предотвратить катастрофу, угрожающую всему ниндзя-миру. Им придётся объединить свои силы, чтобы противостоять Тэмуджину и его таинственным союзникам, раскрывая секреты древней цивилизации. Сможет ли Наруто и его друзья остановить надвигающуюся угрозу, или мир погрузится в хаос? Их приключение только начинается, и битва за будущее уже началась!