В самом начале сюжета губернатор Токио сталкивается с серьёзными угрозами, и только благодаря невероятной смекалке юного детектива Конана [江戸川 コナン] удаётся предотвратить масштабную катастрофу. Взрыв в туннеле метро мог унести сотни жизней, но Конан, используя свою способность предвидеть ходы преступников, успешно нейтрализует угрозу. Однако это лишь начало опасной игры, ведь за этим покушением скрывается куда более сложный заговор.

Расследуя дело, Конан находит зацепку, связывающую преступника с загадочной деревней, которую когда-то перенесли из-за строительства дамбы. Эта информация наводит его на мысль, что следующий удар может быть ещё более разрушительным. Времени на раздумья нет — детектив бросается в погоню за злоумышленником, понимая, что промедление может стоить многих жизней. Каждая минута на счету, и Конан использует все свои навыки, чтобы опередить врага.

Гонка со временем становится всё напряжённее, и Конану приходится не только разгадывать сложные загадки, но и действовать на пределе своих возможностей. Преступник явно не собирается останавливаться, и следующая атака может оказаться фатальной. Сможет ли юный гений предотвратить новую трагедию? Ответ кроется в его уникальном таланте видеть то, что скрыто от глаз обычных людей, и в решимости бороться до конца, даже если ставки невероятно высоки.