Казалось, что после событий Фронтира угроза "шума" исчезла навсегда, а вместе с ней ушла и невыносимая боль, которую он причинял. Однако спокойствие оказалось обманчивым – в порту Йокогамы обнаружили новый экспериментальный образец, обладающий схожими свойствами. Хибики и её союзники вновь оказываются втянуты в опасное противостояние, когда на их пути встаёт загадочная боевая группа, вооружённая неизвестной технологией.

Узнав о появлении невероятно сильного противника, Цубаса срочно возвращается из Англии, чтобы помочь друзьям. Тем временем, носители Мехасимфоний даже не подозревают, что враг уже начал контратаку, и вскоре им предстоит столкнуться с самым тяжёлым испытанием. В неравной схватке, где ставки невероятно высоки, решается судьба всего мира, и только песня способна переломить ход битвы.

С каждым днём конфликт обостряется, а противник использует всё более изощрённые методы атаки. Хибики и её товарищи вынуждены сражаться не только за свою жизнь, но и за будущее, которое теперь зависит от их силы и единства. В этой битве звуков и стали лишь одно может стать ключом к победе – вера в свою песню и тех, кто сражается рядом.