В 0097 году Вселенского Века, через год после событий OVA «Мобильный воин Гандам: Единорог», человечество всё ещё не обрело долгожданного мира. Несмотря на раскрытие тайны «Ящика Лапласа» и формальное признание прав ньютайпов, реальных изменений в обществе почти не произошло. Последний конфликт, вошедший в историю как «Инцидент Лапласа», привёл к окончательному разгрому остатков Нео-Зиона — группировки «The Sleeves». Однако даже после этого в космосе остались неразгаданные загадки, а главное — два легендарных мобильных доспеха, чьи возможности превосходили всё, что знало человечество.

Белый Единорог и Чёрный Лев, участвовавшие в финальной битве, были запечатаны и, казалось, навсегда исчезли из истории. Но судьба приготовила новый сюрприз — спустя два года после событий на Земле объявился третий мобильный доспех серии «Единорог», считавшийся утраченным. Золотой «Фенекс», обладающий невероятной мощью и таинственной связью с прошлым, вновь ввергает мир в хаос. Его появление ставит под сомнение все предыдущие итоги войны и заставляет задуматься: а действительно ли «Ящик Лапласа» раскрыл все свои секреты?

С возвращением «Фенекса» в игру вступают новые силы, каждая из которых преследует свои цели. Одни хотят использовать его мощь для установления нового порядка, другие — уничтожить, чтобы предотвратить катастрофу. В центре событий оказываются пилоты, учёные и политики, чьи судьбы переплетаются в борьбе за будущее человечества. Но главный вопрос остаётся открытым: что скрывает золотой Гандам и почему он появился именно сейчас? Ответ может изменить всё — или окончательно погрузить мир в бесконечную войну.