Аниме рассказывает историю Юкитэру Амано – замкнутого парня, который не умеет общаться со сверстниками. Чтобы понять, как ведут себя обычные люди, он скрупулёзно записывает их поведение в дневник на своём телефоне. Но одиночество давит на него, и в отчаянии Юкитэру придумывает воображаемого друга – "Деус Экс Машину", наделяя его властью над временем и пространством.

Неожиданно этот вымышленный персонаж оживает, сочувствуя главному герою, и дарует ему невероятную силу – дневник, способный предсказывать будущее. Теперь Юкитэру может менять свою судьбу, но вскоре выясняется, что подобные дневники есть и у других подростков. Начинается жестокая борьба за право стать наследником Деуса. Кто же одержит победу в этой смертельной игре?

Этот аниме-сериал сочетает в себе психологическую драму, элементы мистики и напряжённое противостояние, где каждый участник готов на всё ради власти над реальностью.