Юкитэру Амано — обычный школьник, но с одной особенностью: он совершенно не умеет общаться с людьми. Вместо того чтобы заводить друзей, он предпочитает наблюдать за одноклассниками, записывая их поведение в дневник на телефоне. Чтобы скрасить одиночество, парень придумывает воображаемого друга — всемогущего "Деус Экс Машину", способного управлять временем и пространством. Однако фантазия неожиданно становится реальностью, когда этот самый "Деус" проявляет себя как живое существо, сочувствующее Юкитэру.

Внезапно дневник главного героя обретает невероятную силу — теперь его записи предсказывают будущее. Это даёт Юкитэру шанс изменить свою жизнь, но вскоре выясняется, что подобные дневники есть и у других людей. Оказывается, "Деус" выбрал нескольких обладателей, которые должны сразиться за право стать его преемником. Теперь Юкитэру предстоит не только научиться взаимодействовать с окружающими, но и вступить в опасную игру, где ставка — судьба всего мира.

Сможет ли замкнутый парень, привыкший лишь наблюдать со стороны, победить в этой битве? Или его поглотит хаос, который он сам же и разбудил? История превращается в напряжённое противостояние, где каждый участник использует дневник по-своему. Кто-то стремится к власти, кто-то — к справедливости, а Юкитэру пытается просто выжить. Но главный вопрос остаётся открытым: что на самом деле хочет "Деус" и почему он выбрал именно этих людей?