В тот роковой день мир изменился навсегда. Таинственная вспышка озарила небо, превратив всех людей в каменные изваяния. Прошли тысячелетия, прежде чем старшеклассник Тайдзю Оки очнулся от вечного сна. Вокруг него — лишь безмолвные статуи, напоминающие о погибшей цивилизации. Но, к его удивлению, он не одинок в этом опустевшем мире. Его друг Сэнку Исигами, гениальный учёный, уже несколько месяцев строит планы по возрождению человечества.

Сэнку — не просто выживший, он одержим идеей восстановить цивилизацию с помощью науки. Его знания и изобретательность — единственная надежда в этом мире, где природа давно поглотила следы человечества. Вместе с Тайдзю они отправляются в опасное путешествие, чтобы найти других пробудившихся. Но их ждут не только открытия, но и угрозы — ведь в новом мире могут скрываться те, кто не желает возвращения прежнего порядка.

«Доктор Стоун» — это история о силе разума, дружбе и борьбе за будущее. Научные открытия становятся оружием, а каждый шаг героев — шагом к возрождению человечества. Сэнку верит, что с помощью знаний можно преодолеть любые преграды, но сможет ли он убедить в этом других? Впереди их ждут испытания, открытия и, возможно, новые враги, готовые помешать их великой миссии.