Современная Япония живёт в постоянном страхе перед нашествием гигантских чудовищ - кайдзю. Эти исполинские существа методично уничтожают города, оставляя после себя лишь руины и отчаяние. В ответ человечество создало элитные Силы обороны - последний оплот цивилизации в борьбе с неукротимой угрозой.

Среди миллионов, мечтающих вступить в ряды защитников, был и Кафка Хибино. Его детская мечта о героической службе разбилась о суровую реальность - многочисленные провалы на вступительных испытаниях. В 32 года он вынужден довольствоваться ролью уборщика на полях сражений, очищая разрушенные районы от последствий битв с кайдзю.

Но судьба приготовила Кафке неожиданный поворот. Во время рутинной операции по ликвидации останков монстра он сталкивается с таинственным паразитическим существом. В мгновение ока чужеродная форма жизни проникает в его тело, навсегда меняя судьбу простого уборщика и бросая вызов самой природе человеческой идентичности.