Семнадцатилетний гений Шиничи Кудо, прозванный "современным Шерлоком Холмсом", всегда выделялся среди сверстников своим острым умом и наблюдательностью. Однако его жизнь переворачивается с ног на голову после случайной встречи с членами мафиозного клана. Став свидетелем их преступления, парень попадает в ловушку – его заставляют принять загадочную таблетку, после которой он теряет сознание. Очнувшись, Шиничи с ужасом обнаруживает, что его тело уменьшилось до размеров семилетнего ребёнка.

Теперь, скрываясь от преследующих его преступников, Кудо вынужден искать убежище. Он обращается за помощью к своей давней подруге Ран и селится в её доме, представляясь дальним родственником. Отец Ран, владелец детективного агентства, даже не подозревает, что перед ним не обычный мальчик, а талантливый сыщик. Несмотря на детскую внешность, Шиничи сохраняет свои аналитические способности и начинает помогать раскрывать сложные дела, используя новую личину как прикрытие.

Попутно Кудо пытается разгадать тайну загадочной таблетки и найти способ вернуть прежнее тело. Каждое расследование приближает его к разгадке, но и увеличивает риск быть раскрытым. Ведь мафиози всё ещё ищут его, а любая ошибка может стоить жизни. Теперь его главное оружие – не сила, а хитрость и интеллект, которые помогают ему выживать в этом опасном мире, полном загадок и преступлений.