В православной академии Святого Михаила две ученицы — скромная Мафую Орибэ и застенчивая Томо Яманобэ — ежедневно сталкиваются с издевательствами со стороны Миюри Цуджидо, дочери декана, и её подруги Ханы Кацураги. Их жизнь резко меняется, когда по дороге домой они находят бессознательного юношу и решают помочь ему. Этим загадочным незнакомцем оказывается Александр Николаевич Хелл, талантливый алхимик, обладающий властью над химическими элементами.

Саша, как называют его девушки, прибыл в академию с особой миссией — помешать тайной организации «Афон» завладеть древней иконой Царицынской Богоматери, скрытой где-то в стенах учебного заведения. Согласно легенде, эта реликвия хранит ключ к величайшим тайнам мироздания. Чтобы использовать свои силы, квайзеры, к которым принадлежит Саша, нуждаются в соме — особой магической субстанции, добываемой из тел учениц академии.

Способность Саши — управление железом, что делает его грозным противником. Он может в мгновение ока создавать смертоносное оружие, например, огромные косы, из любых металлических предметов. Однако его силы ограничены без регулярного пополнения запасов сомы. Теперь Мафую и Томо предстоит не только защищать нового друга, но и помочь ему раскрыть заговор «Афона», пока не стало слишком поздно.