Наруми Фудзисима — тихий и незаметный школьник, привыкший к одиночеству из-за постоянных переездов. Он не стремится заводить друзей, предпочитая оставаться в тени. Но всё меняется, когда в его жизни появляется Аяка Синодзаки — энергичная и общительная одноклассница, которая буквально врывается в его мир. Она уговаривает его вступить в кружок садоводства, а затем приглашает отметить это событие на своей работе, где Наруми ждёт неожиданная встреча.

Именно там он знакомится с загадочной Алисой — девочкой, которая выглядит на 10-12 лет, но ведёт себя как взрослый гений. Она живёт в комнате, заставленной мониторами и плюшевыми игрушками, решая сложные задачи и раскрывая тайны. Несмотря на юный возраст, Алиса обладает острым умом и необычными способностями, которые помогают ей разбираться в самых запутанных ситуациях. Наруми, привыкший к обыденности, оказывается втянут в её странный, но увлекательный мир.

С этого момента жизнь Наруми переворачивается: он попадает в водоворот событий, где ему предстоит не только узнать секреты Алисы, но и раскрыть собственный потенциал. Вместе они сталкиваются с загадками, которые скрывает город, и каждый новый день приносит неожиданные открытия. Постепенно Наруми понимает, что его прежняя жизнь была лишь тенью того, что ждёт его впереди — мира, полного тайн, приключений и необычных друзей.