Нариюки Юига — обычный старшеклассник, выросший в небогатой семье. Он искренне верит, что упорная учёба — единственный способ изменить свою жизнь и помочь родителям. Не обладая особыми талантами, парень компенсирует это невероятным трудолюбием, став лучшим учеником школы. Однако его размеренной жизни мешает Урука — озорная спортсменка из секции плавания, которая постоянно списывает у него задания и дразнит. Когда директор поручает Нариюки курировать её успеваемость, парень оказывается в неловкой ситуации.

Хотя Нариюки не в восторге от новой роли репетитора, отказаться он не может. Вскоре в их странный дуэт вмешивается третья героиня — Фумино Фурухаси, талантливая писательница, уставшая от гуманитарных наук. Она просит Нариюки помочь ей с точными науками, что вызывает бурю ревности у Уруки. Между девушками разгорается соперничество, а главный герой оказывается в центре этого конфликта. Теперь ему предстоит не только поддерживать свою репутацию отличника, но и балансировать между двумя совершенно разными характерами.

«Мы никогда не учимся в одиночку» — история о том, как три совершенно разных человека меняют друг друга. Нариюки учится быть гибче, Урука открывает для себя мир знаний, а Фумино находит вдохновение в новых предметах. Но сможет ли их необычный союз перерасти во что-то большее? Или школьные будни разведут их по разным дорогам? Этот аниме — тёплая и трогательная комедия о дружбе, взрослении и поиске своего пути.